В 1990 году школа-интернат была преобразована в гимназию. Она начала функционировать как татарская гимназия № 2 – учебное заведение города Казани с преподаванием на родном языке. В 1992 году гимназии было присвоено имя великого татарского просветителя, ученого с мировым именем Шигабутдина Марджани. В 2014 году гимназии присвоили статус центра национального образования, по концепции которого образовательное учреждение становится ресурсной базой Министерства образования и науки Республики Татарстан, Всемирного конгресса татар и Казанского федерального университета по изучению, сохранению и распространению языка, культуры истории татарского народа.

В гимназии функционируют современные учебные кабинеты, оснащенные интерактивными досками, информационными и цифровыми образовательными ресурсами и 7 мобильными кабинетами. Имеется компьютерный центр на 48 рабочих мест, который оснащен мультимедийным оборудованием и видеозалом со спутниковой связью, актовый зал на 190 посадочных мест, оснащенный современной аппаратурой. А также 2 кабинета хореографи, музейный комплекс, борцовский зал.